藏有中国文物的日本机构、个人，列出所有的以下是日本主要博物馆的汇总列表，综合了多个高可信度来源的信息12：
一、国家级博物馆
东京国立博物馆
日本最早国立博物馆，含表庆馆、东洋馆等43个展厅，收藏超10万件文物（含70件国宝）3
京都国立博物馆
藏有平安时代《山水屏风》《饿鬼草纸》等珍贵文物6
九州国立博物馆
聚焦亚洲文化交流，常设展涵盖日本及东亚文物12
国立民族学博物馆（大阪）
收藏11万件世界各民族文物，含中国四合院模型、南太平洋石币等5
二、特色主题博物馆
历史与文化类
江户东京博物馆：再现江户时代东京风貌2
名古屋市博物馆：展示尾张德川家文物2
大津市历史博物馆：琵琶湖区域历史专题2
科技与工业类
日本铁道博物馆（埼玉）：36节火车车厢展示日本140年铁路史7
丰田产业技术纪念馆：丰田纺织机与汽车技术发展1
筑波航天中心：航天科技主题1
艺术与工艺类
美秀博物馆（滋贺）：贝聿铭设计，收藏东亚艺术2
磁浮·铁道馆（神户）：新干线技术展示1
纸张博物馆：传统造纸工艺12
饮食与生活类
新横滨拉面博物馆：日本拉面文化体验1
札幌啤酒博物馆：啤酒酿造历史1
日本酒博物馆：清酒酿造工艺1
三、地方重要博物馆
福井县立恐龙博物馆：恐龙化石专题1
小樽市综合博物馆：北海道历史与自然1
出光美术馆（东京）：日本与亚洲艺术精品2
世田谷美术馆：近现代艺术展览2
福冈市博物馆
四、其他特色场馆
相扑博物馆：相扑运动历史与文物1
烟草与盐博物馆：日本盐业与烟草发展1
惠比寿啤酒纪念馆：啤酒品牌历史1
安藤百福发明纪念馆（横滨/大阪）：方便面发明者纪念1
注：以上列表涵盖日本主要公立及知名私立博物馆，部分小众或地方性场馆未完全列出。如需具体某类博物馆的详细清单，可进一步说明需求12。
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